读fasta格式文件的java程序

zouquan · 发表于 2011-4-24 17:20:22

虽然读fasta文件很简单，但要考虑到到处都可能有多加入的回车，事实上编写程序也不容易

附件代码，不但读入fasta序列，而且把多余的空格、数字删除掉了

如果在使用过程中，还想删除其他特殊字符，修改程序便可

程序用Jbuilder2006写的

xmubingo · 发表于 2011-4-24 22:00:14

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zouquan · 发表于 2013-6-20 02:22:36

计算n50的perl代码（可在linux下运行）

n50.rar (530 Bytes, 下载次数: 0)

计算fasta文件最长长度最短长度和平均长度的java程序（我写的，jar，可在linux运行）

SeqLength.rar (2.63 KB, 下载次数: 2)

运行方法都是程序后加fasta文件名