cuda-convnet(Deep CNN)

xmubingo

论文：http://www.cs.toronto.edu/~fritz/absps/imagenet.pdf
开源项目地址：https://code.google.com/p/cuda-convnet/
（带dropout版本地址：https://github.com/dnouri/cuda-convnet）

输入是不同类别图像，输出是类别。训练样本量百万级别。需要GPU支持。这是最完善的DL code，也是比较成熟的可以应用在大任务上的DL code。（小样本不建议尝试，样本数量<1w）

目前图像非常适合做这个卷积。其他数据也可以尝试，比如‘字典-字向量’，蛋白PSSM矩阵，但是这两个矩阵其实都是一种分布结构，和图像灰度有本质差异，特别是PSSM矩阵已经近似于在描述一段蛋白质序列数据，和DL本身精神相违背。

DL + bioinformatics 路还很远。应该先review下keywords ‘deep learning + bioinformatics’

zouquan

赞哦，code能用吗？我们的66服务器是GPU服务器

xmubingo

zouquan 发表于 2014-6-15 15:36
赞哦，code能用吗？我们的66服务器是GPU服务器

可以的~