生物信息学主要期刊和09年影响因子
根据蛋白名搜索序列的方法(批量编程)
去Uniprot;
比如要Q28298
用java读下面的URL即可
http://www.uniprot.org/uniprot/Q28298.fasta
代码如下:
try{
String id = "Q28298";
String site = "http://www.uniprot.org/uniprot/" +id + ".fasta";
URL url = new URL(si ...
序列比对软件
序列比对软件及blast
[ 2006-10-19 9:21:00 | By: distar ]
比对算法的种类
全局比对
寻找在全长范围内寻找最佳比对。
Needleman-Wunsch algorithm
局部比对
寻找局部区域的最高比对打分,这决定了局部比对的实际应用更加广泛。
Smith-Waterman algorithm
软件blast,fasta等
Blast概述
Blast,全 ...
选择性剪接简介
在很多时候,剪接过程可以透过对同一个基因转录的相同pre-mRNA使用不同的剪接选择,产生不同的mRNA异构物(isoform),最后产生多种相似却又独特的蛋白质,或是产生出稳定性低的mRNA产物以达到调节基因表现的目的。而由于选择性剪接的存在而使基因组可以产生比基因子量还多许多倍的基因产物。
Pre-mRNA的剪接也并不是完美的 ...