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如何在NCBI下载一个物种的EST序列

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发表于 2011-10-28 21:27:47 | 显示全部楼层 |阅读模式
EST是什么,自己去baidu,简单说来就是一段DNA序列,由全世界的科研工作者无组织无纪律瞎测,测完上传汇总在一起,每一条不靠谱的序列就称为一段EST序列。EST一般长为300-800bp。

如何得到某一个物种,比如甜瓜(cucumis melo)的所有EST序列?

首先,去NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/),在 EST数据库 中搜索 cucumis melo
1.jpg

得到的结果中 Send to File, 如果选Fasta,则保存的是Fasta格式的序列,如果选EST,则保存的是标准格式的EST序列(带注释)
2.jpg
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